*شورای سیاستگذاری
این شورا دارای دو بخش حقیقی و حقوقی می باشد . وظایف این شورا تعیین رییس جایزه ، تصویب نوع و مقدار جایزه ، تامین جایزه و تصویب اساسنامه می باشد.
*رییس جایزه
توسط شورای سیاستگذاری تعیین می گردد. برگزاری جلسات شورای هماهنگی، تصویب دستورالعمل برگزاری ، تعیین دبیران جایزه و نظارت عالی بر حسن اجرای دبیرخانه‌های اجرایی و علمی جایزه براساس سیاست‌های کلی شورای علمی و شورای هماهنگی از وظایف ایشان می باشد.
*شورای علمی
شورای علمی جایزه آلاء مرجع اصلی دربرنامه‌های علمی آن به حساب می‌آید وشیوه نامه وکاربرگهای مربوط به داوری وانتخاب برگزیدگان توسط این شورا تدوین وتصویب می‌شود.